مؤسسه آموزشی و پژوهشی امام خمینی (تأسیس ۱۳۷۴ش) از مراکز علمی و پژوهشی در قم که زیر نظر شورای عالی حوزه‌های علمیه قرار دارد و فعالیت آن، مصوّب شورای عالی انقلاب فرهنگی است. ریاست این مؤسسه از ابتدای تأسیس، بر عهده آیت‌الله مصباح یزدی بود و پس از درگذشت او در سال ۱۳۹۹ش، محمود رجبی عهده‌دار آن شد. هدف کلی آن، تربیت طلاب در کنار دروس حوزوی، برای تحقیق، تدوین و تبیین معارف اسلامی است. فعالیت‌های آموزشی مؤسسه در مقاطع تحصیلی کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکترا در رشته‌های مختلف است.
